Ministerstvo dostalo pokutu za nesprávný postup v zakázce „Příprava podkladů a vyplnění žádosti o dotaci v rámci operačního programu životního prostředí – Prioritní osa 3“.
Podle úřadu mělo ministerstvo nepřiměřené požadavky na profesní předpoklady uchazečů. V zadávací dokumentaci stanovilo, že společnosti usilující o zakázku musejí disponovat osvědčením pro přístup k utajovaným informacím až do stupně tajné. Podle ÚOHS byl tento požadavek značně nadhodnocený a omezil tak počet uchazečů, kteří podali nabídku.
Dalším pochybením podle ÚOHS bylo, že ministerstvo nevyloučilo společnost Onyo, která nepředložila doklad o oprávnění k podnikání. Nabídku tohoto uchazeče přitom ministerstvo vybralo jako nejvýhodnější.
Hodnotící komise postupovala podle ÚOHS nesprávně i při zpracování zprávy o posouzení a hodnocení nabídek, když neuvedla nezbytné podrobnosti o hodnocení jednotlivých nabídek. Vzhledem k tomu, že se jedná o nepočitatelné kritérium, mělo ministerstvo podle úřadu věnovat popisu hodnocení obzvláštní pozornost, což však neučinilo.